这是个怪兽会在日常生活中威胁百姓安全的世界。
「日比野卡夫卡」曾立志加入专精讨伐怪兽组织「日本防卫队」,但在不知不觉间放弃了这个梦想,成为了一位专营怪兽清洁业者。「两人一起将怪兽通通消灭!」过去一同立下这个誓言的儿时玩伴「亚白米娜」,现在已成了受人瞩目的第3部队队长,无法与她站上同一阵线的卡夫卡,深深地为自己感到惭愧。然而,以遇见立志加入防卫队的「市川雷诺」为契机,他停止的时间再度动了起来。
为了能站在米娜的身边,为了能从怪兽手中守护百姓,卡夫卡再度朝着过去的梦想迈进。但他却不知道,怪兽的威胁,正以他料想不到的方式接近他......